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用于苏木精和伊红(H&E)染色组织病理学图像中细胞核检测与分类的排他自编码器(XAE)

计算机视觉与模式识别 2018-11-29 v1

摘要

在本文中,我们介绍了一种新颖的特征提取方法,称为排他自编码器(XAE),它是自编码器(AE)的有监督版本,能够大幅提升苏木精和伊红(H&E)组织病理学图像中细胞核检测与分类的性能。所提出的 XAE 可用于任何基于 AE 的算法,只要在特征提取阶段也提供数据标签。在实验中,我们评估了一种结合 XAE 与全连接神经网络(FCN)的方法的性能,并与一些基于 AE 的方法进行了比较。对于乳腺癌 H&E 图像上的细胞核检测问题(视为细胞核/非细胞核分类问题),所提出的 XAE+FCN 方法的 F 值达到了 96.64%,而最先进水平为 84.49%。对于结直肠癌 H&E 图像上的细胞核分类,标注了上皮、炎症、成纤维和杂项四类细胞核,所提出方法的 F 值达到 70.4%。我们还提出了一种淋巴细胞分割方法。在淋巴细胞检测步骤中,我们与前沿技术进行了比较,并将性能从 90% 提升至 98.67%。我们还基于细胞核检测与分类提出了一种淋巴细胞分割算法。所获得的 Dice 系数达到 88.31%,而前沿方法为 74%。

关键词

引用

@article{arxiv.1811.11243,
  title  = {eXclusive Autoencoder (XAE) for Nucleus Detection and Classification on Hematoxylin and Eosin (H&E) Stained Histopathological Images},
  author = {Chao-Hui Huang and Daniel Racoceanu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1811.11243},
  year   = {2018}
}

备注

11 pages, 7 figures, 5 tables, conference paper