多变量连续时间连续性状高斯演化于树状图上对数似然 Hessian 的精确表达式
种群与进化
2024-05-14 v1
摘要
本文给出一族沿给定树状图的多变量连续性状高斯马尔可夫演化模型的似然 Hessian 矩阵的闭式公式, 其中特征向量的均值是其祖先特征向量的仿射函数, 方差不依赖于特征。配套本工作的 R 软件包称为 'glinvci', 可在 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 上获取, 该软件包能够计算基于 Hessian 的近似置信区间, 同时允许用户处理缺失数据、丢失特征以及多种演化制度。
引用
@article{arxiv.2405.07394,
title = {Exact Expressions for the Log-likelihood's Hessian in Multivariate Continuous-Time Continuous-Trait Gaussian Evolution along a Phylogeny},
author = {Woodrow Hao Chi Kiang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.07394},
year = {2024}
}
备注
Part of a thesis (DOI:10.3384/9789180755900)