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增强扩散与酶解离

软凝聚态物质 2020-02-04 v2 生物大分子

摘要

催化酶可作为将化学活性转化为运动的分子机器的概念在概念和实验上均有支持,但许多声称的支持来自底物浓度高于生物学相关水平并因此超过米氏常数 kM 的实验条件。此外,迄今实验研究过的许多酶为寡聚体。脲酶作为亚基六聚体,一直被视为证明增强扩散的黄金标准。本文表明,在高催化活性的脲酶及某些其他寡聚酶在 kM 以上时解离为扩散更快的较小亚基片段,从而在此浓度区间内提供了一种简单的增强扩散物理机制。考虑到该结论可能引起争议,我们的发现得到四种独立分析技术的支持:静态光散射、动态光散射(DLS)、尺寸排阻色谱(SEC)和荧光相关光谱(FCS)。脲酶的数据置于正文,而己糖激酶和乙酰胆碱酯酶的结论在补充信息中以数据验证。对于这些酶不解离的 kM 以下底物浓度区间,我们来自 FCS 和 DLS 的发现证实了酶催化确实导致增强扩散现象。

关键词

引用

@article{arxiv.1909.03283,
  title  = {Enhanced diffusion and enzyme dissociation},
  author = {Ah-Young Jee and Kuo Chen and Tsvi Tlusty and Jiang Zhao and Steve Granick},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1909.03283},
  year   = {2020}
}

备注

7 pages, 5 figures, supplementary information