EMERALD-UI：揭示亚最优比对空间中新奇蛋白生物学的交互式 Web 应用
定量方法
2026-02-16 v1
摘要
过去四十亿年中，生命是由蛋白质及其装配成三维构象的能力所塑造的。蛋白质序列比对一直是探索生命树中蛋白质演化和功能适应的关键技术。近期在仅凭 primary sequence 从预测三维蛋白质结构方面的进展揭示了不同模式的保守性和功能在序列和结构层面 operate。这种蛋白质保守模式及其在亚最优比对配置中可能产生的功能变化往往被 optimal protein alignment 方法所忽略。我们引入 EMERALD-UI，一个开源的交互式 Web 应用，旨在通过可视化揭示亚最优比对空间中隐藏的稳定结构构象或蛋白质区域。
关键词
引用
@article{arxiv.2602.12730,
title = {EMERALD-UI: An interactive web application to unveil novel protein biology hidden in the suboptimal-alignment space},
author = {Andrei Preoteasa and Andreas Grigorjew and Alexandru I. Tomescu and Hajk-Georg Drost},
journal= {arXiv preprint arXiv:2602.12730},
year = {2026}
}