与蛋白质对话：面向蛋白分析的交互式多模态共科学家
生物大分子
2025-10-22 v1 人工智能
摘要
构建蛋白质的工作心理模型通常需要数周的阅读、交叉验证晶体和预测结构，以及检查配体复合物，过程缓慢、可及性不均且常需专业计算技能。我们引入\emph{Speak to a Protein}，一种新的能力，使蛋白质分析变为与专家共科学家进行的交互式多模态对话。该AI系统检索并综合相关文献、结构和配体数据；在动态3D场景中进行 grounding；可以高亮、标注、操作和查看可视化。系统还能在需要时生成和运行代码，并以文本和图形解释结果。我们在相关蛋白质上演示这些功能，提出有关结合口袋、构象变化或结构活性关系的问题，以实时测试想法。\emph{Speak to a Protein}显著缩短从问题到证据的时间，降低先进结构分析的门槛，并通过紧密耦合语言、代码和3D结构，实现假设生成。\emph{Speak to a Protein}已开放访问于 https://open.playmolecule.org。
引用
@article{arxiv.2510.17826,
title = {Speak to a Protein: An Interactive Multimodal Co-Scientist for Protein Analysis},
author = {Carles Navarro and Mariona Torrens and Philipp Thölke and Stefan Doerr and Gianni De Fabritiis},
journal= {arXiv preprint arXiv:2510.17826},
year = {2025}
}