静电势作为某些腰果酸衍生物抗菌活性的描述符:基于密度泛函理论的研究
化学物理
2015-08-12 v1
摘要
通过在气相以及DMSO和水溶液中,在密度泛函理论(DFT)的M06-2X/6-31G(d,p)、WB97XD/6-31G(d,p)和B3LYP/6-31G(d,p)水平上的全几何优化,研究了腰果酸及其部分衍生物的结构和最小分子静电势(MEP)分布。溶剂效应采用极化连续模型的积分方程形式处理。研究了C1侧链修饰对各区域最小MEP值的影响。被用于执行多元线性回归的,是C2-OH基团氧原子附近、C1连接的脲或硫脲基团的氧或硫原子附近、以及被认为参与受体相互作用的环平面上方或下方的最小MEP值。由此表明,实验观察到的这些分子针对金黄色葡萄球菌(S. aureus)的抗菌活性与上述区域的最小MEP值相关。在研究中使用的三种DFT泛函中,发现M06-2X泛函产生最可靠的结果。已对该类别的某些分子的抗菌活性进行了预测,需通过实验验证。
引用
@article{arxiv.1508.02551,
title = {Electrostatic Potential as a Descriptor of Anti-Bacterial Activities of Some Anacardic Acid Derivatives: A Study Using Density Functional Theory},
author = {Manish K. Tiwari and P. C. Mishra},
journal= {arXiv preprint arXiv:1508.02551},
year = {2015}
}