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基于联邦学习的高效SARS-CoV-2刺突序列分类

机器学习 2023-11-10 v2

摘要

本文提出一种联邦学习(FL)方法来训练用于SARS-CoV-2变异株分类的AI模型。我们以分布式方式分析SARS-CoV-2刺突序列,无需数据共享,以检测这种快速突变冠状病毒的不同变异株。我们的方法保持了本地数据(可能存储在不同位置)的机密性,同时使我们能够可靠地检测和识别新型冠状病毒SARS-CoV-2的不同已知和未知变异株。使用所提方法,我们在冠状病毒变异株识别任务上达到了93%的总体准确率。我们还提供了所提模型如何遵循联邦学习主要法则的细节,例如数据所有权法则、数据隐私法则、模型聚合法则和模型异构性法则。由于所提模型是分布式的,它可以轻松扩展到“大数据”。我们计划利用这一概念验证来实现隐私保护的疫情响应策略。

关键词

引用

@article{arxiv.2302.08688,
  title  = {Efficient Classification of SARS-CoV-2 Spike Sequences Using Federated Learning},
  author = {Prakash Chourasia and Taslim Murad and Zahra Tayebi and Sarwan Ali and Imdad Ullah Khan and Murray Patterson},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2302.08688},
  year   = {2023}
}

备注

10 pages, 7 figures, Accepted at 10th International Conference on Information Management and Big Data (SIMBig 2023)