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使用随机游走重启算法和帕金森病本体数据库的药物重定位

定量方法 2024-08-31 v1 机器学习 生物大分子

摘要

帕金森病是一种进行性、缓慢发展的神经退行性疾病,其特征是大脑黑质区域的多巴胺能神经元丢失。尽管科学家进行了广泛研究,但目前尚无治愈方法,现有疗法主要有助于减轻部分帕金森症状。药物重定位(即为现有药物寻找新用途的过程)作为一种高效的方法受到更多认可,它可以减少开发新药所需的时间、资源和风险。在本研究中,我们设计了一个新颖的计算平台,整合了基因表达数据、生物网络和PDOD数据库,以识别可能的帕金森病治疗药物重定位候选物。通过使用机器学习方法(如RWR算法和PDOD评分系统),我们排列药物-疾病转换,并根据其可能的疗效对潜在候选物进行排序。我们提出基因表达分析、网络优先级排序和药物靶点数据分析,以全面评估药物重定位的机会。我们的研究结果突出了这些疗法作为有希望的药物候选物,可用于帕金森病治疗的进一步研究。我们还通过使用多种数据源和计算方法,为有前景的药物重定位思路提供了理论依据。

关键词

引用

@article{arxiv.2404.08711,
  title  = {Drug Repurposing for Parkinson's Disease Using Random Walk With Restart Algorithm and the Parkinson's Disease Ontology Database},
  author = {Pratham Kankariya and Rachita Rode and Kevin Mudaliar and Pranali Hatode},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2404.08711},
  year   = {2024}
}

备注

5 pages, Final Year Engineering Project on Machine Learning and Healthcare Industry