冷冻电子断层成像中大分子语义特征的解耦
生物大分子
2021-06-29 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
冷冻电子断层成像(Cryo-ET)是一种三维成像技术,能够以近原子分辨率对单细胞中大分子结构的形状、丰度和分布进行系统性研究。然而,由于结构复杂性与成像限制,对 Cryo-ET 所捕获大分子结构进行系统性、高效的 识别与复原极具挑战。即便结构相同的大分子,也会因取向不同及噪声、缺失楔效应等成像限制而呈现多样外观。显式解耦大分子的语义特征对于在其上开展若干下游分析至关重要。本文提出一种三维空间变分自编码器来解决该问题,其显式解耦大分子的结构、取向与位移。在合成与真实 Cryo-ET 数据集上的大量实验以及跨域评估证明了我们方法的有效性。
引用
@article{arxiv.2106.14192,
title = {Disentangling semantic features of macromolecules in Cryo-Electron Tomography},
author = {Kai Yi and Jianye Pang and Yungeng Zhang and Xiangrui Zeng and Min Xu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2106.14192},
year = {2021}
}