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神经退行性疾病间的疾病知识迁移

机器学习 2019-07-30 v2 计算机视觉与模式识别 定量方法 机器学习

摘要

我们提出疾病知识迁移(DKT),一种在相关神经退行性疾病间迁移生物标志物信息的新技术。DKT 通过从常见神经退行性疾病的大规模多模态数据集迁移信息,即使在仅有有限的单模态数据可用时,也能推断罕见神经退行性疾病中稳健的多模态生物标志物轨迹。DKT 是一种生物标志物进展的联合疾病生成模型,它利用跨疾病共享的生物标志物关系。我们提出的方法首次实现了在后皮质萎缩(PCA)——一种仅有单模态 MRI 数据的罕见神经退行性疾病——中估计合理的多模态生物标志物轨迹。为此,我们在包含两种不同疾病及不同数据量的合并数据集上训练 DKT:1)来自 TADPOLE Challenge 的较大规模多模态典型 AD(tAD)数据集;2)来自 Dementia Research Centre (DRC) 的较小规模单模态后皮质萎缩(PCA)数据集,其仅有有限数量的磁共振成像(MRI)扫描。尽管由于 PCA 中缺乏数据使得验证具挑战性,我们在合成数据与两个患者数据集(TADPOLE 与 PCA 队列)上验证 DKT,表明其能在模拟中估计真值参数,并在两个患者数据集上预测未见生物标志物。虽然我们在阿尔茨海默病变体中演示了 DKT,但我们注意到 DKT 可推广至其他形式的 related 神经退行性疾病。DKT 源代码在线可得:https://github.com/mrazvan22/dkt。

关键词

引用

@article{arxiv.1901.03517,
  title  = {Disease Knowledge Transfer across Neurodegenerative Diseases},
  author = {Razvan V. Marinescu and Marco Lorenzi and Stefano B. Blumberg and Alexandra L. Young and Pere P. Morell and Neil P. Oxtoby and Arman Eshaghi and Keir X. Yong and Sebastian J. Crutch and Polina Golland and Daniel C. Alexander},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1901.03517},
  year   = {2019}
}

备注

accepted at MICCAI 2019, 13 pages, 5 figures, 2 tables