二聚体元动力学
统计力学
2016-07-19 v1 生物物理
摘要
对复杂势能进行采样是当代计算科学中最紧迫的挑战之一。受近期利用量子效应和离散化 Feynman 路径积分来克服高能垒的研究启发，我们提出了一种副本交换方法。在每个副本中，同一系统的两个具有减半势能强度的副本通过非弹性弹簧相互作用。在不同副本中改变弹簧强度，以弥合对应于 Boltzmann 副本的无限强弹簧与较松弹簧之间的差距。我们利用元动力学增强了弹簧长度波动。我们在简单但具挑战性的问题上测试了该方法。
引用
@article{arxiv.1607.04846,
title = {Dimer Metadynamics},
author = {Marco Nava and Ferruccio Palazzesi and Claudio Perego and Michele Parrinello},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.04846},
year = {2016}
}