DIA-MCIS：用于转录网络中网络模体发现及其他拓扑可观测量的重要性采样网络随机化器
定量方法
2007-06-04 v1
摘要
转录网络和其他有向网络可以通过一些拓扑可观测量来表征，例如子图出现（网络模体）。为了进行此类分析，必须能够生成合适的随机化网络系综。通常，人们会考虑与原始网络具有相同度序列的零模型网络。常用的算法有时具有较长的收敛时间和采样问题。我们在此提出了一种替代方法，该方法基于 Chen 等人 [1] 开发的重要性采样蒙特卡罗的变体。
引用
@article{arxiv.0706.0118,
title = {DIA-MCIS. An Importance Sampling Network Randomizer for Network Motif Discovery and Other Topological Observables in Transcription Networks},
author = {D. Fusco and B. Bassetti and P. Jona and M. Cosentino Lagomarsino},
journal= {arXiv preprint arXiv:0706.0118},
year = {2007}
}
备注
6 pages and 1 figure, included supplementary mathematical notes