子图计数综述:概念、算法及其在网络模体与图元中的应用
数据结构与算法
2021-12-30 v1
摘要
计算子图频率是一项基础任务,处于若干网络分析方法的中心,例如网络模体和基于图元的度量,它们已被广泛用于分类和比较来自多个领域的网络。然而,计数子图在计算上非常昂贵,并且已有大量关于高效算法和策略的工作,以使子图计数对更大的子图和网络可行。本综述旨在精确提供子图计数现有方法的全面概览。我们的主要贡献是对现有算法进行通用且结构化的回顾,基于一组关键特征对它们分类,突出其主要异同。我们识别并描述了主要的概念性方法,洞察其优势与局限,并给出已有实现的指引。我们最初关注精确串行算法,但也对近似方法(在精度与执行时间之间权衡)和并行策略(需要处理不平衡搜索空间)进行了详尽调研。
引用
@article{arxiv.1910.13011,
title = {A Survey on Subgraph Counting: Concepts, Algorithms and Applications to Network Motifs and Graphlets},
author = {Pedro Ribeiro and Pedro Paredes and Miguel E. P. Silva and David Aparicio and Fernando Silva},
journal= {arXiv preprint arXiv:1910.13011},
year = {2021}
}
备注
35 pages