单分子膜轨迹中限制和跳跃的检测
定量方法
2009-11-11 v2 统计力学
亚细胞过程
摘要
我们提出了Simson等人算法的变体 [R. Simson, E.D. Sheets, K. Jacobson, Biophys. J. 69, 989 (1995)]。他们的算法旨在检测扩散膜蛋白或脂质的实验单粒子追踪轨迹中的瞬态限制区。我们表明，我们的算法能够检测比Simson等人的算法更广泛的限制势形状。此外，它不仅能检测瞬态限制，还能检测限制区之间的跳跃。跳跃由膜骨架栅栏和栅栏模型预测。在属于G蛋白偶联受体家族的μ-阿片受体（参与信号转导途径）的实验轨迹的情况下，该算法证实限制不能仅用刚性栅栏来解释。
引用
@article{arxiv.q-bio/0507031,
title = {Detection of confinement and jumps in single molecule membrane trajectories},
author = {N. Meilhac and L. Le Guyader and L. Salome and N. Destainville},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0507031},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 3 figures