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基于 GC-EI-MS 谱图的小分子从头识别

数据分析、统计与概率 2023-04-05 v1 机器学习

摘要

对未知化合物实验获取质谱的识别是一项特殊挑战,因为可靠的谱图数据库未能以足够密度覆盖潜在化学空间。因此,基于机器学习的从头(de-novo)方法——直接从质谱推导分子结构——近来受到关注。我们提出该家族中的一种新方法,针对 GC-EI-MS 谱图这一特定用例,由于缺乏先前发表方法所依赖的 MS/MS 实验第一阶段的附加信息,该用例尤为困难。我们分析了该方法的优势与不足,并讨论了未来方向。

关键词

引用

@article{arxiv.2304.01634,
  title  = {De-novo Identification of Small Molecules from Their GC-EI-MS Spectra},
  author = {Adam Hájek and Michal Starý and Filip Jozefov and Helge Hecht and Elliott Price and Aleš Křenek},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2304.01634},
  year   = {2023}
}