相关函数量化超分辨图像并估计由过度计数引起的表观聚集
生物物理
2012-03-13 v1 定量方法
摘要
我们提出了一种分析方法，用于量化二维静态表面超分辨定位图像中的聚集。该方法还描述了标记分子的过度计数如何导致表观自聚集，以及如何确定图像的有效横向分辨率。此处理适用于膜中蛋白质和脂质的聚集，该领域对使用超分辨定位技术探测膜非均匀性有浓厚兴趣。当使用对相关函数量化图像时，由过度计数引起的表观聚集程度将与标记分子的表面密度成反比，且不依赖于平均分子被计数的次数。在双标记实验中测量对互相关函数时，过度计数不会产生表观共聚集。我们应用该分析方法，通过随机光学重构显微镜（STORM）和扫描电子显微镜（SEM）获取的图像，量化了化学固定 RBL-2H3 肥大细胞质膜上 IgE 受体（FcεRI）的分布。我们发现，用这两种方法检测到的与 FcεRI 结合的标记 IgE 的表观聚集，源于对单个复合物的过度计数。因此，我们的结果表明，在这些实验的分辨率和灵敏度限制内，这些受体是随机分布的。
引用
@article{arxiv.1106.6068,
title = {Correlation functions quantify super-resolution images and estimate apparent clustering due to over-counting},
author = {Sarah Veatch and Benjamin Machta and Sarah Shelby and Ethan Chiang and David Holowka and Barbara Baird},
journal= {arXiv preprint arXiv:1106.6068},
year = {2012}
}
备注
22 pages, 5 figures