中文

介质连续模型 IV:溶剂化能对原子坐标的解析梯度计算

化学物理 2013-03-19 v3

摘要

本文描述了求解溶剂化能对原子坐标的解析梯度(导数)的方法。该方法既适用于非极性部分,也适用于通过 PCM、COSMO 和 SGB 方法求得的极性部分。这些梯度的求解利用了表面网格参数(坐标、法向量和面积)的解析梯度。表面网格位于两种最优光滑分子表面上:溶剂排除表面(SES)以及由 SES 导出的溶剂可及表面(SAS)。这些表面根据本系列前文所述算法,通过一次和二次滚动方法求得。

关键词

引用

@article{arxiv.1108.1667,
  title  = {Continual Model of Medium IV: Calculation of analytical gradients for solvation energy over atomic coordinates},
  author = {Oleg Kupervasser and N. E. Wanner},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1108.1667},
  year   = {2013}
}

备注

26 pages, 4 figures, paper in English and in Russian