基于质谱的自下而上蛋白质组学综合概述
定量方法
2023-11-15 v1
摘要
蛋白质组学是通过蛋白质鉴定与定量，从生物系统中大规模研究蛋白质结构与功能的学科。“鸟枪蛋白质组学”或“自下而上蛋白质组学”是主流策略，其中蛋白质被水解为肽段，再通过质谱分析。蛋白质组学研究可应用于从简单的蛋白质鉴定到蛋白质型、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质结构改变、绝对与相对蛋白质定量、翻译后修饰以及蛋白质稳定性等多样研究。为支持这一系列不同的实验，存在多种蛋白质组分析策略。蛋白质组学工作流程之间的差异细节对于新从业者可能难以理解。在此，我们提供不同蛋白质组学方法的综合概述，以协助新手与经验丰富的研究者。内容涵盖从生物化学基础、蛋白质提取到生物学解释与正交验证。我们期望本工作能作为鸟枪法或自下而上蛋白质组学领域新从业者的基础资源。
引用
@article{arxiv.2311.07791,
title = {Comprehensive Overview of Bottom-up Proteomics using Mass Spectrometry},
author = {Yuming Jiang and Devasahayam Arokia Balaya Rex and Dina Schuster and Benjamin A. Neely and Germán L. Rosano and Norbert Volkmar and Amanda Momenzadeh and Trenton M. Peters-Clarke and Susan B. Egbert and Simion Kreimer and Emma H. Doud and Oliver M. Crook and Amit Kumar Yadav and Muralidharan Vanuopadath and Martín L. Mayta and Anna G. Duboff and Nicholas M. Riley and Robert L. Moritz and Jesse G. Meyer},
journal= {arXiv preprint arXiv:2311.07791},
year = {2023}
}