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用于组织病理学高级可视化的复合生物标志物图像

图像与视频处理 2023-12-27 v1 计算机视觉与模式识别

摘要

免疫组化(IHC)生物标志物是可靠癌症诊断与分型的重要工具。其需要在IHC和苏木精-伊红(H&E)切片的整张幻灯片图像(WSIs)间进行交叉染色比对。目前,病理学家为得出最终诊断,需检视IHC与H&E玻璃切片上视觉共定位区域,这是一项繁琐且具挑战的任务。此外,来回目视检查不同IHC切片以分析局部共表达,即便由经验丰富的病理学家操作,也固有地主观且易出错。依托数字病理学,我们在本工作中提出复合生物标志物图像(CBI)。CBI是一幅可使用不同滤波后IHC生物标志物图像合成以更好可视化的单一图像。我们提出由所提方案两步生成的CBI图像,以实现更好可视化及更高效临床工作流。第一步,将IHC生物标志物图像与H&E图像用同一坐标系与朝向对齐。第二步,基于病理学家建议,从各生物标志物图像中滤波出阳性或阴性IHC区域,并用模糊推理系统合成至一幅图像。为评估,所提系统生成的CBI图像由专家病理学家定性评价。CBI概念帮助病理学家更易识别可疑目标组织,并可通过在相同可疑区域检视实际WSIs进一步评估。

关键词

引用

@article{arxiv.2304.12423,
  title  = {Composite Biomarker Image for Advanced Visualization in Histopathology},
  author = {Abubakr Shafique and Morteza Babaie and Ricardo Gonzalez and Adrian Batten and Soma Sikdar and H. R. Tizhoosh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2304.12423},
  year   = {2023}
}