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竞争-定殖权衡促进低毒力病毒株的共存

种群与进化 2015-03-17 v3

摘要

RNA病毒以遗传多样性群体存在,表现出不同的表型,包括不同程度的毒力。然而,病毒群体中毒力的进化尚不清楚。基于一个RNA病毒克隆在细胞培养中分化成两个不同毒力亚群的实验观察,我们研究了异质病毒群体的动力学和毒力的进化。我们将竞争-定殖权衡引入标准的宿主内病毒感染数学模型。定殖者是快速传播的强毒株,而竞争者是在共感染细胞内更成功的低毒力变种。我们观察到群体的双相动力学:感染早期群体由定殖者主导,随后它们将被竞争者取代。模拟表明存在一个稳态,其中少数低毒力变种共存。这种平衡意味着群体中的集体毒力衰减,这与先前预测群体向毒力增强方向发展的模型相反。然而,如果我们在模型中包含一个高度简化的免疫反应,衰减效应就会消失。因此,竞争-定殖权衡表明了毒力在调节病毒群体多样性中的作用。毒力的进化是群体的一种动态特征,由个体间的相互作用和斑块状栖息地的结构所塑造。

关键词

引用

@article{arxiv.1101.3065,
  title  = {Competition-colonization trade-off promotes coexistence of low-virulence viral strains},
  author = {Samuel Ojosnegros and Edgar Delgado-Eckert and Niko Beerenwinkel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1101.3065},
  year   = {2015}
}

备注

This paper has been withdrawn by the authors. 17 pages, 5 figures. Submitted to journal, currently under review. Supplementary material can be obtained from the corresponding author upon request via email. Withdrawn due to issues with the journal we submitted the manuscript to