同类相较——使用模块化可适配分析流程比较异质数据集中的慢脑节律
神经元与认知
2024-01-09 v2 定量方法
摘要
神经科学正朝着更具整合性的学科发展，理解脑功能需要整合跨实验、跨物种和跨测量技术所积累的实证。该路径上的一项剩余挑战是将此类异质数据整合进分析工作流，从而提炼出一致且可比较的结论，作为模型与理论的实验基础。在此，我们在慢波活动（ Hz）的背景下提出一种解决方案，该活动出现在睡眠和全身麻醉等无意识脑状态中，并在多种实验方法中被观测到。我们通过概念化一个可适配于多种输入与应用的一般流程设计，来解决异质数据的整合与比较问题。此外，我们提出协作脑波分析流程（Cobrawap）作为一个具体的、可复用的软件实现，用于对多个公开可用的 ECoG 与钙成像数据集的慢波特征进行广泛、细致且严格的比较。
引用
@article{arxiv.2211.08527,
title = {Comparing apples to apples -- Using a modular and adaptable analysis pipeline to compare slow cerebral rhythms across heterogeneous datasets},
author = {Robin Gutzen and Giulia De Bonis and Chiara De Luca and Elena Pastorelli and Cristiano Capone and Anna Letizia Allegra Mascaro and Francesco Resta and Arnau Manasanch and Francesco Saverio Pavone and Maria V. Sanchez-Vives and Maurizio Mattia and Sonja Grün and Pier Stanislao Paolucci and Michael Denker},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.08527},
year = {2024}
}