CoMOGrad与PHOG：从计算机视觉到快速准确的蛋白质三级结构检索
计算机视觉与模式识别
2014-09-03 v1 计算工程、金融与科学
信息检索
摘要
由于技术的进步，蛋白质结构数据库中的条目数量日益增加。从这一大型数据库中检索蛋白质三级结构的方法是对结构进行比较分析的关键，而结构比较分析对于理解蛋白质及其功能起着重要作用。在本文中，我们提出了从大型数据库中检索与查询蛋白质具有相似三级结构的蛋白质的快速准确方法。我们提出的方法借鉴了计算机视觉领域的思想。我们方法的速度和准确性来自于两个新引入的特征：方向梯度共生矩阵和方向梯度金字塔直方图，以及使用欧氏距离作为距离度量。实验结果清楚地表明我们的方法在运行时间和准确性上的优越性。我们的方法可从此网站直接使用：http://research.buet.ac.bd:8080/Comograd/。
引用
@article{arxiv.1409.0814,
title = {CoMOGrad and PHOG: From Computer Vision to Fast and Accurate Protein Tertiary Structure Retrieval},
author = {Rezaul Karim and Mohd. Momin Al Aziz and Swakkhar Shatabda and M. Sohel Rahman and Md. Abul Kashem Mia and Farhana Zaman and Salman Rakin},
journal= {arXiv preprint arXiv:1409.0814},
year = {2014}
}
备注
draft