生物系统全局动力学的评论

在最近的一项研究中，(Grigorov, 2006) 利用奇异谱分析（SSA）结合蒙特卡洛奇异谱分析（Monte-Carlo SSA），分析了果蝇实验中产生的时序基因表达谱（Arbeitman et al., 2002）。作者（Grigorov, 2006）在文章中提出了三个重要主张，即：主张1：一种基于非线性时间序列分析理论的新方法被用于捕捉果蝇周期时序基因表达谱的全局动力学。主张2：特征谱的显著部分被平坦化，证实了关于潜在的高维混沌生成过程的假设。主张3：蒙特卡洛奇异谱分析可用于判断给定的时间序列是否可与任何明确定义的过程（包括确定性混沌）相区分。本报告以简单的例子系统性地对上述主张（Grigorov, 2006）提出了根本性的质疑。所提供的讨论尤其不赞成在任何生物学范式中采用奇异谱分析来推断时间序列的非线性动力学结构。