结合三维 PET 与光学投影层析成像技术用于植物根系表型分析
定量方法
2015-01-05 v1 生物物理
摘要
研究地下植物根系系统的新成像技术需求迫切,因为根系在作物生产中扮演着重要角色。与其他非破坏性成像模态相比,PET 可以在自然土壤中对植物根系进行成像,并产生揭示植物-环境相互作用时间动态的动态三维功能图像。在本研究中,我们将 PET 与光学投影层析成像(OPT)相结合,以评估其在植物根系表型分析中的潜力。我们使用了一台专用的高分辨率植物 PET 成像仪,其横向视场为 14 cm,轴向视场为 10 cm,并具备多床成像能力。图像分辨率约为 1.25 mm,使用 ML-EM 重建算法。B73 自交系玉米种子被萌发后,在装有透明凝胶基质的密封罐中生长。PET 扫描从第一片绿叶出现那天开始,持续 5 天,每天一次。每天早晨,约 10 mCi 的 11CO2 被导入一个定制的植物标记室。10 分钟后,用新鲜空气吹扫残留活性,然后开始 2 小时的 PET 扫描。对于 OPT 成像,罐子被放置在一个装满水的丙烯酸立方容器中,由均匀面光源照明,并由数码单反相机从 72 个角度拍摄光学图像以进行 OPT 重建。同一植物每天由 OPT 系统成像 3 次。从光学图像中测量植物根系生长。共配准的 PET 和光学图像表明,PET 图像中后期出现的大多数热点对应于生长最活跃的根尖。PET 在根尖测量的 11C 分配量与 OPT 测量的最终根系生长之间存在强线性相关性,这表明我们可以将 PET 用作表型分析工具,以测量植物在不同环境情景下如何做出地下碳分配决策。
引用
@article{arxiv.1501.00242,
title = {Combined 3D PET and Optical Projection Tomography Techniques for Plant Root Phenotyping},
author = {Qiang Wang and Sergey Komarov and Aswin J. Mathews and Ke Li and Christopher Topp and Joseph A. O'Sullivan and Yuan-Chuan Tai},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.00242},
year = {2015}
}
备注
5 pages, 10 figures