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基于深度分布的多示例学习用于结直肠癌生存预测

图像与视频处理 2022-11-30 v2 计算机视觉与模式识别

摘要

已有若干深度学习算法被开发用于利用全切片图像(WSIs)预测癌症患者的生存情况。然而,对于临床医生和深度学习算法而言,识别 WSI 中与患者生存和疾病进展相关的图像表型均十分困难。大多数用于生存预测的基于深度学习的多示例学习(MIL)算法使用顶部实例(如最大池化)或顶部/底部实例(如 MesoNet)来识别图像表型。在本研究中,我们假设 WSI 内补丁得分分布的全局信息能更好地预测癌症生存。我们开发了基于分布的多示例生存学习算法(DeepDisMISL)以验证该假设。我们使用两个大型国际结直肠癌 WSI 数据集——MCO CRC 和 TCGA COAD-READ——设计并执行了实验。我们的结果表明,关于 WSI 补丁得分分布的信息越多,预测性能越好。在每个所选分布位置(如百分位数)周围包含多个邻域实例可进一步改善预测。DeepDisMISL 相较于其他近期发表的先进算法表现出更优的预测能力。此外,我们的算法具有可解释性,可辅助理解癌症形态表型与患者癌症生存风险之间的关系。

关键词

引用

@article{arxiv.2204.11294,
  title  = {Colorectal cancer survival prediction using deep distribution based multiple-instance learning},
  author = {Xingyu Li and Jitendra Jonnagaddala and Min Cen and Hong Zhang and Xu Steven Xu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2204.11294},
  year   = {2022}
}