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ClustGeo:用于带空间约束的层次聚类的 R 包

统计计算 2018-02-27 v2 机器学习

摘要

本文提出一种包含空间/地理约束的类似 Ward 的层次聚类算法。输入两个相异度矩阵 D0D_0D1D_1,以及混合参数 α[0,1]\alpha \in [0,1]。相异度可以是非欧式的,观测的权重可以非均匀。第一个矩阵给出“特征空间”中的相异度,第二个矩阵给出“约束空间”中的相异度。每个阶段最小化的准则是用 D0D_0 计算的同质性准则与用 D1D_1 计算的同质性准则的凸组合。其思想是确定一个 α\alpha 值,使得在空间连续性增加的同时不太多地恶化基于感兴趣变量(即特征空间中的变量)的解的质量。该过程使用 R 包 ClustGeo 在真实数据集上进行了说明。

关键词

引用

@article{arxiv.1707.03897,
  title  = {ClustGeo: an R package for hierarchical clustering with spatial constraints},
  author = {Marie Chavent and Vanessa Kuentz-Simonet and Amaury Labenne and Jérôme Saracco},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1707.03897},
  year   = {2018}
}