CloudSTRUCTURE：在云端推断群体结构
定量方法
2014-08-19 v1 基因组学
种群与进化
摘要
我们推出了 CloudSTRUCTURE，这是一款用于运行群体遗传学程序 STRUCTURE 并行分析的应用程序。该高性能计算（HPC）就绪型应用程序由 iPlant 网络基础设施驱动，提供了一种快速（通过并行化）且便捷（通过用户友好的图形界面）的方法，用于计算多个 K 值（遗传群体数量）和迭代次数下的似然值。结果会自动汇总，以便更轻松地确定最适合数据的 K 值。此外，CloudSTRUCTURE 将重新格式化 STRUCTURE 的输出，以供下游程序（如 TASSEL）使用，从而进行考虑群体结构效应分层的关联分析。
引用
@article{arxiv.1408.4081,
title = {CloudSTRUCTURE: infer population STRUCTURE on the cloud},
author = {Liya Wang and Doreen Ware},
journal= {arXiv preprint arXiv:1408.4081},
year = {2014}
}
备注
2 pages