跨膜蛋白经历光循环时光透射的特征噪声特征
化学物理
2015-05-27 v1 生物物理
生物大分子
摘要
我们展示了一种基于噪声测量的技术，该技术可用于研究蛋白质组装体中的动力学过程。在光刺激下直接观察膜蛋白系统（如细菌视紫红质 (bR)）的动力学是相当具有挑战性的。bR 代表了一个模型系统，其中刺激触发的结构动力学与生物学功能直接相关。我们的方法利用透射模式下的泵浦-探测近场显微方法，并涉及分析来自有限尺寸分子组装体的透射率涨落。表明有限尺寸效应和统计关联影响的概率密度分布，在 bR 的噪声谱中表现为特征频率分布，其起源可追溯到光循环动力学。通过对 bR 及其突变体 D96N 作为温度、湿度或存在额外泵浦源等外部参数的函数进行噪声研究，获得了对分子过程的宝贵见解。
引用
@article{arxiv.1101.5230,
title = {Characteristic noise features in light transmission across membrane protein undergoing photocycle},
author = {Anshuman. J. Das and Sabyasachi Mukhopadhyay and K. S. Narayan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1101.5230},
year = {2015}
}
备注
13 Pages, 3 Figures, To appear in the Journal of Chemical Physics, Vol. 134, Issue 6