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细胞实例分割:边界才是魔鬼

计算机视觉与模式识别 2025-10-14 v1

摘要

基于深度学习语义分割方法的状态最佳(SOTA)细胞实例分割方法侧重于区分前景像素与背景像素。为了从前景像素(例如像素聚类)中识别细胞实例,大多数方法将实例信息分解为像素级目标,如到前景-背景边界的距离图(distance maps)、以中心点为热源的热梯度(heat diffusion maps)以及具有固定角度的从中心点到前景-背景边界的距离(星形多边形)。然而,像素级目标可能丢失大量细胞实例的几何属性,如形状、曲率和凸性,这些属性需要一组像素来表示。为解决这一挑战,我们提出了一种新型像素聚类方法,称为 Ceb(即 Cell boundaries),以利用细胞边界特征和标签将前景像素划分为细胞实例。首先,Ceb 从语义分割概率图中提取潜在的前景-前景边界,采用修订后的水位算法。对于每个边界候选区域,Ceb 通过对当前前景-前景边界以及相邻背景-前景边界的像素进行采样构建边界特征表示(称为边界签名)。随后,使用边界分类器预测其二元边界标签。最后,根据预测的边界标签对相邻区域进行划分或合并以获得细胞实例。在六个数据集上的大量实验表明,Ceb 在语义分割概率图上优于现有的像素聚类方法。此外,Ceb 在与 SOTA 细胞实例分割方法进行比较时也表现出高度竞争的性能。

关键词

引用

@article{arxiv.2510.09848,
  title  = {Cell Instance Segmentation: The Devil Is in the Boundaries},
  author = {Peixian Liang and Yifan Ding and Yizhe Zhang and Jianxu Chen and Hao Zheng and Hongxiao Wang and Yejia Zhang and Guangyu Meng and Tim Weninger and Michael Niemier and X. Sharon Hu and Danny Z Chen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2510.09848},
  year   = {2025}
}

备注

Accepted at IEEE Transactions On Medical Imaging (TMI)