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基于云计算资源的室内环境中 SARS-CoV-2 传播风险评估案例研究

分布式、并行与集群计算 2022-06-13 v1 计算工程、金融与科学 计算机与社会

摘要

复杂流动模拟传统上在 HPC 集群上执行。然而,HPC 资源的有限可用性以及在传统超级计算机基础设施上运行的陡峭学习曲线,已引起对将流动模拟软件部署到云上的关注。我们展示了一个复杂计算框架——可评估各类室内教室场景中的 COVID-19 传播风险——如何被抽象并部署于云服务上。此类基于云的个人化规划工具的可用性,可使教育机构、医疗机构、公共部门工作者(法院、警察局、机场等)及其他实体全面评估各种面对面交互场景的传播风险。我们将该模拟框架部署于 Azure 云框架上,利用 Dendro-kT 网格生成工具与 PETSc 求解器。云抽象由 RocketML 云基础设施提供。我们将云机器的性能与最先进的 HPC 机器 TACC Frontera 进行比较。我们的结果表明,基于云的 HPC 资源是多样化终端用户快速高效部署模拟软件的可行策略。

关键词

引用

@article{arxiv.2111.09353,
  title  = {Case study of SARS-CoV-2 transmission risk assessment in indoor environments using cloud computing resources},
  author = {Kumar Saurabh and Santi Adavani and Kendrick Tan and Masado Ishii and Boshun Gao and Adarsh Krishnamurthy and Hari Sundar and Baskar Ganapathysubramanian},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2111.09353},
  year   = {2022}
}

备注

Accepted for publication at SuperCompCloud: 5th Workshop on Interoperability of Supercomputing and Cloud Technologies