脑肿瘤遗传网络生存特征
基因组学
2023-08-17 v2 神经元与认知
组织与器官
摘要
肿瘤异质性越来越被认为是神经肿瘤学领域治疗成功的主要障碍。胶质瘤的特征在于遗传和表观遗传改变的独特组合，导致跨多个分子通路的复杂相互作用。预测疾病演变和开具个体最优治疗方案需要足够复杂的统计模型，以捕捉支撑肿瘤发生的复杂（表观）遗传结构。在此，我们将此任务形式化为遗传网络的分层潜在表示中不同连接模式的推断。我们评估了来自 12 个国家、14 年间 4023 名胶质瘤患者的多机构临床、遗传和结果数据，采用贝叶斯生成随机块模型揭示了跨越分子确认的胶质母细胞瘤（IDH- 野生型）、少突胶质细胞瘤（IDH- 突变和 1p/19q 共缺失）以及星形细胞瘤（IDH- 突变）的肿瘤遗传学分层网络结构。我们的发现阐明了脑肿瘤遗传景观中特征之间的复杂依赖关系，并表明生成网络模型揭示了不同的生存特征，其预后保真度优于当前金标准诊断类别。
引用
@article{arxiv.2301.06111,
title = {Brain tumour genetic network signatures of survival},
author = {James K Ruffle and Samia Mohinta and Guilherme Pombo and Robert Gray and Valeriya Kopanitsa and Faith Lee and Sebastian Brandner and Harpreet Hyare and Parashkev Nachev},
journal= {arXiv preprint arXiv:2301.06111},
year = {2023}
}
备注
Main article: 52 pages, 1 table, 7 figures. Supplementary material: 13 pages, 11 supplementary figures