基于 BioBERT 从生物医学文献中抽取 SNP-性状关联
计算与语言
2023-08-08 v1
摘要
科学文献包含大量信息，为开发文本挖掘方法以抽取生物医学关系提供了极佳机会。一类重要的信息是单核苷酸多态性（SNP）与性状之间的关系。在本文中，我们提出一种 BioBERT-GRU 方法来识别 SNP-性状关联。基于我们的方法在 SNPPhenA 数据集上的评估，得出结论：这一新方法优于先前基于机器学习和深度学习的方法。BioBERT-GRU 取得了精确率 0.883、召回率 0.882 和 F1 值 0.881 的结果。
引用
@article{arxiv.2308.02569,
title = {BioBERT Based SNP-traits Associations Extraction from Biomedical Literature},
author = {Mohammad Dehghani and Behrouz Bokharaeian and Zahra Yazdanparast},
journal= {arXiv preprint arXiv:2308.02569},
year = {2023}
}