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将 SNOMED-CT 术语绑定到原型元素:建立结果基线

定量方法 2024-02-21 v1

摘要

引言:本文是《医学信息方法》(METHODS of Information in Medicine)“管理医疗系统中的互操作性与复杂性”焦点主题的一部分。背景:原型作为表示电子健康记录信息的手段日益普及,这产生了将其元素与术语代码(如 SNOMED CT 代码)进行绑定的需求,以便唯一地识别它们。然而,术语库的巨大规模使得手动执行此任务变得困难。目标:通过使用现成的基于字符串比较的技术为上述问题建立结果基线,以便评估更复杂技术的结果。方法:使用一组 487 个原型元素评估了九种 Typed Comparison METHODS 用于绑定的效果。计算了它们的召回率,并应用了 Friedman 和 Nemenyi 检验以评估是否有任何方法优于其他方法。结果:如果考虑 90% 的置信水平,使用 qGrams 方法结合原型元素的'Text'信息片段优于其他方法。如果仅为每个原型元素检索一个 SNOMED CT 术语,则获得的召回率为 25.26%。如果分别检索 10 个和 100 个元素,该召回率上升至 50.51% 和 75.56%,这意味着 SNOMED CT 代码集减少了 99.99% 以上。结论:根据上述结果建立了基线。此外,观察到虽然基于字符串比较的方法并未优于更复杂的技术,但它们仍然可以作为一种替代方案,为每个原型元素提供一组缩减的候选术语,以便在极有可能需要的人工监督任务中随后选择最终术语。

关键词

引用

@article{arxiv.2402.12383,
  title  = {Binding SNOMED-CT Terms to Archetype Elements: Establishing a Baseline of Results},
  author = {Idoia Berges and Jesús Bermúdez and Arantza Illarramendi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2402.12383},
  year   = {2024}
}

备注

This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in Methods of Information in Medicine 54(1) : 45-49 (2015), copyright 2015 Schattauer. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.3414/me13-02-0022