多组同量异位素标记质谱数据中蛋白质差异表达的贝叶斯识别
应用统计
2014-07-25 v1 定量方法
摘要
本文开发了一种贝叶斯统计推断方法，用于统一分析跨多个实验的同量异位素标记 MS/MS 蛋白质组学数据。我们建立了一个明确的概率模型，用于描述跨多个预定义组和实验的同量异位素标记报告离子的对数强度。随后，利用该模型开发了一套完整的贝叶斯统计方法论，用于识别相对于对照组在多个组和实验中差异表达的蛋白质。该方法论已得以实现，并在模拟数据以及两个模型实验数据集（其中差异表达蛋白质已知）上进行了评估，这些数据集采用了 TMT 标记方案。
引用
@article{arxiv.1407.6519,
title = {Bayesian identification of protein differential expression in multi-group isobaric labelled mass spectrometry data},
author = {Howsun Jow and Richard J. Boys and Darren J. Wilkinson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.6519},
year = {2014}
}