高度混杂病例对照研究中利用样本重测的批次效应校正
统计方法学
2023-11-07 v1
摘要
批次效应在生物医学研究中普遍存在。解决批次效应的一种方法是在每批次中重复测量一部分样本。这些重测样本被用于估计并校正批次效应。然而,利用重测样本进行批次效应校正的严格统计方法严重匮乏。在本研究中,我们开发了一个在高度混杂病例对照研究中利用重测样本进行批次效应校正的框架。我们对所提过程提供了理论分析,评估了其功效特征,并提供了一个功效计算工具以辅助研究设计。我们发现需要重测的样本数量强烈依赖于批次间相关性。当相关性较高时,重测一小部分样本有可能挽救大部分功效。
引用
@article{arxiv.2311.03289,
title = {Batch effect correction with sample remeasurement in highly confounded case-control studies},
author = {Hanxuan Ye and Xianyang Zhang and Chen Wang and Ellen L. Goode and Jun Chen},
journal= {arXiv preprint arXiv:2311.03289},
year = {2023}
}
备注
45 pages