分子马达中的后退步、隐藏子步与条件驻留时间
生物大分子
2010-10-18 v1
摘要
进程性分子马达沿空间周期性轨道采取大致均匀大小的步长，多向前但在负载下后退渐多。实验中主要步长在噪声内可清晰分辨，但从生化角度知每个酶循环中有一个或多个机械化学子步仍隐藏。为正确解释后退/前进步比、平均条件步步驻留时间等实验数据，发展了考虑N态序贯模型中隐藏子步的首达分析。显式通用结果与此前将观测步等同于完整机械化学循环的处理显著不同；例如，前进与后退步前的平均驻留时间τ_+与τ_-通常不等，而连续前进与后退步间的驻留时间τ_{++}与τ_{--}相等。示例性(N=2)态模型展现出广泛行为。该表述可扩展至多态循环中含隐藏子步的两个或以上可检测跃迁情形。
引用
@article{arxiv.q-bio/0611051,
title = {Back-stepping, hidden substeps, and conditional dwell times in molecular motors},
author = {Denis Tsygankov and Martin Lindén and Michael E. Fisher},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0611051},
year = {2010}
}