用于离轴数字全息显微术的自动化傅里叶空间区域识别滤波
光学
2016-07-26 v1 组织与器官
摘要
生物样品的自动化无标记定量成像可极大促进高通量疾病诊断。数字全息显微术(DHM)是一种强大的定量无标记成像工具,可非侵入性地获取细胞样品的结构细节。在离轴 DHM 中,傅里叶空间中适当的空间滤波窗口对重建相位图像的质量至关重要。本文描述了一种将形状识别与迭代阈值化相结合的区域识别方法,以提取频率分量的最佳形状。该区域识别技术提供全自动自适应滤波,可适用于多种样品和成像条件。当通过光学散射生物水凝胶基质成像时,该技术超越了以往的直方图阈值化技术,无需任何手动干预。最后,我们自动化提取了疟疾寄生虫感染与未感染红细胞之间光学高度的统计差异。本文描述的方法为在厚细胞培养物中实现活细胞自动化 DHM 成像的更大自主性铺平了道路。
引用
@article{arxiv.1607.04404,
title = {Automated Fourier space region-recognition filtering for off-axis digital holographic microscopy},
author = {Xuefei He and Chuong Vinh Nguyen and Mrinalini Pratap and Yujie Zheng and Yi Wang and David R. Nisbet and Richard J Williams and Melanie Rug and Alexander G. Maier and Woei Ming Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.04404},
year = {2016}
}