在MedDRA中自动编码药物不良反应
计算与语言
2017-01-18 v3
摘要
药物警戒是致力于收集、分析和预防药物不良反应（ADRs）的科学。从自由文本资源提取 ADR 信息的高效策略对支持专家工作至关重要，这些专家负责检测和分类可能与药物服用相关的意外病理这一关键任务。叙述性 ADR 描述可通过多种方式收集，例如通过监控社交网络或经由所谓自发报告——药物警戒采用以识别 ADR 的主要方法。根据 MedDRA 标准术语对自由文本 ADR 描述进行编码是报告分析的核心。这是一项复杂工作，必须由药物警戒专家手动实施。手动编码昂贵（就时间而言）。此外，由于报告数量日益增长，可能出现编码准确性问题。在本文中，我们提出 MagiCoder，一种高效的自然语言处理算法，能够从自由文本 ADR 描述自动导出 MedDRA 术语。MagiCoder 是 VigiWork 的一部分，后者是一个用于在线 ADR 报告和分析的 Web 应用。从实际角度看，MagiCoder 从根本上减少了 ADR 报告的修订时间：药理学家只需修订和验证自动解，而非在 MedDRA 的 70k 术语中艰难选择解决方案。这种专家工作效率的改进对数据分析质量有显著影响。此外，我们的程序是通用的。我们为意大利药物警戒语言开发了 MagiCoder，但初步分析表明它对语言和词典变化具有鲁棒性。
引用
@article{arxiv.1506.08052,
title = {Automagically encoding Adverse Drug Reactions in MedDRA},
author = {Carlo Combi and Riccardo Lora and Ugo Moretti and Marco Pagliarini and Margherita Zorzi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1506.08052},
year = {2017}
}
备注
Submitted, 22 pages, 3 figures, 3 tables