AutoKary2022:用于染色体实例分割的大规模密集标注数据集
计算机视觉与模式识别
2023-04-26 v3
摘要
从中期细胞显微图像中自动进行染色体实例分割对于染色体异常的诊断(即核型分析)至关重要。然而,由于缺少密集标注数据集以及染色体形态复杂(如分布密集、方向任意、长度跨度大),该任务仍具挑战性。为推动该领域发展,我们迈出重要一步,手动构建了名为 AutoKary2022 的大规模密集标注数据集,其包含来自 50 名患者的 612 张显微图像中超过 27,000 个染色体实例。具体而言,每个实例均标注了多边形掩码与类别标签,以辅助精确的染色体检测与分割。在此基础上,我们系统地研究了该数据集上的代表性方法并获得若干有趣发现,有助于深入理解染色体实例分割中的基本问题。希望该数据集能推动面向医学认知的研究。数据集可从以下地址获取:https://github.com/wangjuncongyu/chromosome-instance-segmentation-dataset。
引用
@article{arxiv.2303.15839,
title = {AutoKary2022: A Large-Scale Densely Annotated Dataset for Chromosome Instance Segmentation},
author = {Dan You and Pengcheng Xia and Qiuzhu Chen and Minghui Wu and Suncheng Xiang and Jun Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.15839},
year = {2023}
}
备注
Accepted by ICME 2023