自编码脑网络及其在大规模脑成像数据分析中的应用
机器学习
2021-09-14 v3 机器学习
神经元与认知
摘要
从多种成像模态推断人脑连接组并探索其与认知等人类特质的关系,已引起巨大关注。脑连接组通常表示为网络,节点对应不同的感兴趣区域(ROI),边对应 ROI 之间的连接强度。由于网络的高维和非欧几里得特性,刻画其总体分布并将其与人类特质关联具有挑战性。现有方法侧重于使用预先指定的拓扑特征或主成分分析(PCA)来汇总网络。在本文中,基于深度学习的近期进展,我们开发了非线性潜因子模型来刻画脑图的总体分布,并推断脑结构连接组与人类特质之间的关系。我们将该方法称为图自编码(GATE)。我们将 GATE 应用于两个大规模脑成像数据集——青少年脑认知发展(ABCD)研究和成人人类连接组计划(HCP),以理解结构脑连接组及其与认知的关系。数值结果证明了 GATE 在预测精度、统计推断和计算效率方面相对于对比方法的巨大优势。我们发现,与以往方法相比,结构连接组与广泛的人类认知特质具有更强的关联。
引用
@article{arxiv.1911.02728,
title = {Auto-encoding brain networks with applications to analyzing large-scale brain imaging datasets},
author = {Meimei Liu and Zhengwu Zhang and David B. Dunson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1911.02728},
year = {2021}
}
备注
31 pages, 12 figures, 5 tables