流体力学相互作用在疏水塌缩动力学中重要吗?
软凝聚态物质
2012-08-31 v1 统计力学
生物物理
摘要
我们研究了具有不同疏水性的两个平板的组装动力学,包括发生去润湿以及水强烈溶剂化平板表面的情况。平均力势和分子尺度流体力学是作为粒子间距的函数,通过显式溶剂中的分子动力学模拟计算得出的。与我们最近关于纳米球的工作 [J. Phys. Chem. B 116, 378 (2012)] 一致,发现高摩擦区域是由大而慢的溶剂涨落引起的。这些慢涨落可能是由去润湿或限域引起的。组装的平均首次通过时间是通过显式溶剂中的分子动力学模拟以及沿反应路径的布朗动力学模拟计算的。布朗动力学利用了我们确定的平均力势和流体力学分布。令人惊讶的是,尽管溶剂慢弛豫在组装过程中起作用,但我们发现全尺度分子动力学与布朗动力学之间存在合理的一致性。我们发现分子尺度的流体力学相互作用对于描述组装动力学至关重要。
引用
@article{arxiv.1208.6170,
title = {Are hydrodynamic interactions important in the kinetics of hydrophobic collapse?},
author = {Jingyuan Li and Joseph A. Morrone and B. J. Berne},
journal= {arXiv preprint arXiv:1208.6170},
year = {2012}
}
备注
6 figures, 13 pages