增强采样方法在生物分子自组装中的应用：综述
软凝聚态物质
2025-03-03 v1
摘要
本综述文章讨论了与生物分子自组装过程相关的一些常见增强采样方法。首先介绍了自组装及其面临的挑战，随后简要概述了副本交换分子动力学、伞形采样、元动力学以及基于机器学习的技术的方法与分析。讨论了选定方法在肽、蛋白质、聚合物、核酸和超分子中的应用。最后，对其中一些方法的未来发展方向进行了简短讨论。
引用
@article{arxiv.2502.21148,
title = {Applications of Enhanced Sampling Methods to Biomolecular Self-Assembly: A Review},
author = {Mason Hooten and Het Patel and Yiwei Shao and Rishabh Kumar Singh and Meenakshi Dutt},
journal= {arXiv preprint arXiv:2502.21148},
year = {2025}
}