APPLE Picker：自动颗粒挑选，一种低人工投入的冷冻电镜框架
计算机视觉与模式识别
2018-08-06 v2
摘要
颗粒挑选是单颗粒冷冻电子显微镜(cryo-EM)计算流程中关键的第一步。从显微照片中挑选颗粒尤为困难，尤其对低对比度的小颗粒。由于高分辨率重建通常需要数十万颗粒，手动挑选如此多颗粒往往过于耗时。虽然半自动颗粒挑选目前是流行方法，但可能将人工偏置引入筛选过程；此外，半自动颗粒挑选仍较耗时。本文提出 APPLE(Automatic Particle Picking with Low user Effort) picker，一种快速、准确且完全自动颗粒挑选的简洁新颖方法。尽管我们的思路受模板匹配启发，却完全无模板。该方法在含 -galactosidase 与 keyhole limpet hemocyanin 投影显微照片的公开数据集上进行了评估。
引用
@article{arxiv.1802.00469,
title = {APPLE Picker: Automatic Particle Picking, a Low-Effort Cryo-EM Framework},
author = {Ayelet Heimowitz and Joakim Andén and Amit Singer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1802.00469},
year = {2018}
}
备注
18 pages, 14 figures