ApisTox：一个新的用于小分子对蜜蜂毒性分类的基准数据集
定量方法
2024-12-02 v3 人工智能
机器学习
生物大分子
摘要
全球蜜蜂种群的下降对农业、生物多样性和环境稳定性构成了重大风险。为弥补现有数据的不足，我们引入了ApisTox，这是一个专注于农药对蜜蜂（Apis mellifera）毒性的综合数据集。该数据集整合并利用了来自ECOTOX和PPDB等现有来源的数据，提供了一个广泛、一致且经过精心整理的数据集合，超越了以往的数据集。ApisTox包含了大量数据，包括化学品的毒性水平、其在文献中发表的时间等详细信息，以及将其链接到外部化学数据库的标识符。该数据集可作为环境与农业研究的重要工具，同时也能支持旨在减少对蜜蜂种群危害的政策与实践的制定。最后，ApisTox为农用化学品的分子性质预测方法提供了独特的基准测试资源，促进了环境科学与化学信息学的进步。这使其成为蜜蜂保护学术研究与实际应用中的宝贵工具。
引用
@article{arxiv.2404.16196,
title = {ApisTox: a new benchmark dataset for the classification of small molecules toxicity on honey bees},
author = {Jakub Adamczyk and Jakub Poziemski and Pawel Siedlecki},
journal= {arXiv preprint arXiv:2404.16196},
year = {2024}
}