抗生素耐药性微生物学数据集 (ARMD):来自电子健康记录的抗菌药物耐药性资源
定量方法
2025-07-23 v2 信息检索
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摘要
抗生素耐药性微生物学数据集 (ARMD) 是一个从电子健康记录 (EHR) 中提取的去标识化资源,用于支持抗菌药物耐药性 (AMR) 研究。ARMD 涵盖来自两所学术附属医院逾 15 年间收集的成年患者大数据,重点包括微生物培养、抗生素敏感性及相关临床与人口学特征。关键属性包括病原体鉴定、55 种抗生素的敏感性模式、隐含敏感性规则以及去标识化患者信息。该数据集支持抗菌药物管理、因果推断和临床决策研究。ARMD 旨在实现可复用与互操作,以促进合作与创新,共同应对 AMR 挑战。本文描述了数据集的获取、结构与效用,并详细说明了其去标识化流程。
引用
@article{arxiv.2503.07664,
title = {Antibiotic Resistance Microbiology Dataset (ARMD): A Resource for Antimicrobial Resistance from EHRs},
author = {Fateme Nateghi Haredasht and Fatemeh Amrollahi and Manoj Maddali and Nicholas Marshall and Stephen P. Ma and Lauren N. Cooper and Andrew O. Johnson and Ziming Wei and Richard J. Medford and Sanjat Kanjilal and Niaz Banaei and Stanley Deresinski and Mary K. Goldstein and Steven M. Asch and Amy Chang and Jonathan H. Chen},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.07664},
year = {2025}
}