配对scRNA-Seq与多重空间蛋白质组学中蛋白质组与转录组不一致性分析
组织与器官
2023-07-04 v1 基因组学
摘要
本研究利用来自HuBMAP的配对scRNA-Seq与多重空间蛋白质组学数据，分析转录组与蛋白质组之间的不一致性。我们的发现强调了关键免疫标志物中持续存在的转录本，包括CD45-RO、Ki67、CD45、CD20和HLA-DR。CD45-RO在记忆T细胞中持续表达，而与细胞增殖相关的Ki67也表现出持续表达。此外，作为MHC II类分子一部分的HLA-DR呈现连续表达，可能对于抗原呈递细胞（APCs）引发有效免疫应答至关重要。该探究为基因表达调控与蛋白质功能的复杂性提供了新见解。
引用
@article{arxiv.2307.00635,
title = {Analyzing Lack of Concordance Between the Proteome and Transcriptome in Paired scRNA-Seq and Multiplexed Spatial Proteomics},
author = {Jai Prakash Veerla and Jillur Rahman Saurav and Michael Robben and Jacob M Luber},
journal= {arXiv preprint arXiv:2307.00635},
year = {2023}
}