利用平铺分箱散点图矩阵分析染色质
计算工程、金融与科学
2014-07-23 v1 定量方法
摘要
背景：近年来，越来越多的生物数据变得可用。除了新数据的纯粹数量外，其维度（即每个数据点的不同属性数量）也有所增加。最近，关于染色质及其修饰的数据量显著增加。在表观遗传学领域，目前尚缺乏旨在突出表观遗传数据不同方面的适当可视化工具。结果：我们提出了一种名为 TiBi-Scatter 的工具，用于进行二维相关性分析。该方法允许在分析多维数据的同时保持内存等资源的使用量较小。因此，它特别适用于大型数据集。结论：TiBi-Scatter 是一种资源友好且易于使用的工具，允许对大型多维生物数据集进行无假设分析。
引用
@article{arxiv.1407.2084,
title = {Analyzing Chromatin Using Tiled Binned Scatterplot Matrices},
author = {Dirk Zeckzer and Daniel Gerighausen and Lydia Steiner and Sonja J. Prohaska},
journal= {arXiv preprint arXiv:1407.2084},
year = {2014}
}
备注
BioVis 2014 conference