小鼠青光眼发生的 RNA 测序分析
基因组学
2022-10-05 v1
摘要
青光眼是 60 岁以上人群不可逆失明的主要原因,在 2010 年占所有失明的 6.6% 至 8%,但关于这一眼病的遗传起源仍有许多未知。随着下一代测序(NGS)技术的现代发展,科学家们开始更多地了解青光眼的遗传起源。本研究使用差异表达(DE)和基因本体(GO)分析来研究患有严重青光眼的小鼠与多个对照组之间的遗传差异。来自 NCBI(NIH)的视盘(ONH)和视网膜全基因组 RNA 表达数据样本被用于两两比较实验。此外,采用主成分分析(PCA)和离散度可视化方法进行测序数据的质量控制检验。具有偏斜基因计数的基因也被识别出来,因为它们可能是特定严重程度青光眼的标记基因。本实验发现的基因本体支持现有的青光眼发生知识,为结果的有效性提供了信心。未来的研究者可以深入研究由 DE 和 GO 分析生成的基因列表,以寻找小鼠青光眼的潜在激活或保护基因,从而开发药物治疗或基因疗法以减缓或阻止疾病进展。总体目标是未来也能为人类制定此类疗法,以改善青光眼人类患者的生活质量并降低青光眼致盲率。
引用
@article{arxiv.2210.01546,
title = {An RNA Sequencing Analysis of Glaucoma Genesis in Mice},
author = {Jai Sharma and Vidhyacharan Bhaskar},
journal= {arXiv preprint arXiv:2210.01546},
year = {2022}
}
备注
6 pages, 6 figures