基于本体描述电子实验室笔记中的纳米 CT 测量：从元数据模式到首个用户体验

近年来，越来越多地讨论了在众多科研领域确保良好文档化元数据的重要性。将所有在科学研究期间生成的元数据以可发现、可访问、可互操作且可重用（FAIR）方式提供给社区，仍是跨学科研究人员面临的重大挑战。科学社区正在通过采用语义 web 技术将所有数据以语义注释知识图谱的形式可用，来实现这一目标。大多数现有方法未能以一致且社区达成的标准化方式收集元数据，且缺乏支持将其转化为知识图谱的工具。我们提出了一种示例解决方案，其中在科学过程的最初阶段创建 schema 和 ontology，然后借助电子实验室笔记框架 Herbie，将其转化为定制数据收集平台，以促进实验期间对元数据的验证和语义注释。以同步辐射源基于纳米 CT 测量为例，我们展示了一种能够灵活且直观地捕获此类科学仪器复杂元数据的整体方法。该方法可考虑该 beamline 的不同仪器配置，提供用户友好的体验。我们展示了 Herbie 如何将所有语义文档转化为可访问的用户界面，其中所有输入的数据自动满足 FAIR 要求，并且展示了如何无需熟悉知识图谱的精细结构即可通过 competency questions 直接提取数据。