基于 Cox 回归与共表达分析的免疫相关 lncRNA 对 SKCM 患者预后预测模型
基因组学
2020-06-18 v1
摘要
SKCM 是皮肤癌中最危险的一种，其高度恶性是皮肤癌致死的主要原因。而放疗与化疗水平有限，故死亡率高。由于其复杂的分子与细胞异质性，现有的皮肤癌风险预测模型并不理想。本研究我们构建了一个免疫相关 lncRNA 模型以预测 SKCM 患者的预后。从 TCGA 中筛选 SKCM 相关的差异表达 lncRNA。基于共表达方法鉴定免疫相关 lncRNA 及 lncRNA 相关 mRNA。通过单因素与多因素分析，建立免疫相关 lncRNA 模型以分析 SKCM 患者预后。构建了包含 MIR155HG、AL137003.2、AC011374.2 与 AC009495.2 的 4-lncRNA 皮肤癌预测模型。依据该模型，将 SKCM 样本分为高风险组与低风险组，并预测两组 30 年生存情况。ROC 曲线下面积为 0.749，表明该模型具有优良性能。我们构建了 4-lncRNA 模型预测 SKCM 患者预后，表明这些 lncRNA 可能在 SKCM 癌变中发挥独特作用。
引用
@article{arxiv.2006.09856,
title = {An Immune-related lncRNAs Model for Prognostic of SKCM Patients Base on Cox Regression and Coexpression Analysis},
author = {Wenjie Jiang and Chang Lu and Jing Qu and Xiaoyu Mei},
journal= {arXiv preprint arXiv:2006.09856},
year = {2020}
}